96/02/01 口生所與臨床醫學研究所，共同聘任邱士華擔任兼任副教授
96/02/01 博士班學生曾羽辛(指導老師林姝君教授)，參加「中華民國細胞及分子生物學學會」所主辦的「第15屆細胞及分子生物新知研討會」(96/02/01-96/02/03)，獲得「優秀壁報論文獎」
96/03 徐媺茹同學(指導老師洪善鈴教授)、余承佳同學(指導老師羅正汎副教授)，通過審查，獲得本校95學年度第2學期「碩士生逕修讀博士班獎學金」
96/03/27 本所陳信雄、余承佳、廖翊妏、郭昱甫同學，參加國立陽明大學第二屆研究生球類比賽「三對三籃球賽」，勇奪季軍96/04/14 博士班學生呂萱萱(指導老師張國威教授)，獲本校經費補助參萬元，出席國際會議，赴美國洛杉磯參加美洲癌症研究學會 (AACR) (96/04/14-96/04/18)
96/04/14 博士班學生呂萱萱(指導老師張國威教授)，獲本校經費補助參萬元，出席國際會議，赴美國洛杉磯參加美洲癌症研究學會 (AACR) (96/04/14-96/04/18)
96/06/14 首度舉辦「博士班迎新活動」
96/06/14 研究生參加「95學年度學術論文研討會」榮獲兩項大獎：
•博四黃頌銜(指導老師夏堪臺) -榮獲「臨床醫學、公共衛生、護理學組」優等獎
•博五謝宗明(指導老師張國威) -榮獲「基礎研究組」優等獎
96/06/23 博士班學生曾羽辛(指導老師林姝君教授)，參加榮總台灣聯合大學96年合作研究計畫（第三期）成果發表會，榮獲三項大獎：(1)「壁報展示第二名」－計畫主持人：劉宗榮教授；(2)「壁報展示第二名」－計畫主持人：張國威教授；(3)「壁報展示第三名」－計畫主持人：林姝君教授
96/07 博士班研究生曾羽辛、謝宗明、涂筱培獲得博士學位，為本所首屆博士班畢業生
96/07/25 牙醫學院洪善鈴、林姝君、張國威、黃何雄、王育才五位教師，獲得本校96-97年「教師學術卓越獎勵」
96/08/01 96學年度碩士班新生名額增加為12人
96/08/01 牙醫系楊世芳老師退休
96/08/01 聘任中央研究院生物醫學科學研究所李德章研究員，擔任本所兼任教授
96/08/01 「牙醫學系」及「臨床牙醫學研究所」整併更名為「牙醫學系」，由許明倫老師，擔任系主任
96/08/01 下列師生，申請本校「學士班學生參與研究工作」獲得補助─牙四林岫慧（洪善鈴老師）、牙四孔怡文（黃何雄老師）、牙三成函潔（張蓮鈺老師）、牙三劉亭勻（張蓮鈺老師）、牙二楊惇茹（林姝君老師）、牙二許昭舜（季麟揚老師）
96/08/30 黃何雄教授，獲中華民國防蝕工程學會96年度「陳讚立防蝕研發獎」之研究獎（獎金十萬元）
96/09/01 牙醫系五年級簡杏宜同學（指導老師黃何雄教授），榮獲全國「牙醫系學生臨床研究計畫比賽」第一名，該競試首度以英文進行比賽，簡杏宜同學並代表台灣參加2007年美國牙醫學會年會之決賽
96/09/01 博士班一年級楊志雄同學（指導老師黃何雄教授），獲行政院原子能委員會核能研究所博士班研究生獎學金（獎金共計240,000元）(96/10/01-99/03/31)
96/09/01 博士班學生姚道禮（指導老師陳恆理助理教授），獲外交部臺灣獎學金每月三萬元補助（合計1,080,000元）（2007/09/01-2010/08/31）
96/10/02 牙醫系許明倫主任榮獲本校95學年度「教學優良教師獎」
96/10/24 洪善鈴、林姝君、賴玉玲三位教師，獲頒牙醫學院「95學年度教學認真獎」
96/12/04 博士班梁世佑（指導老師夏堪臺）參加國際合作研究交換學生計畫，獲得經費補助，於96年12月4日至96年12月14日前往越南河內National Institute of Hygiene and Epidemiology研習交流
96/12/05 國立陽明大學牙醫學院與上海交通大學口腔醫學院簽署兩校交流及合作備忘錄
96/12/14 口生所及牙醫系舉行96學年度系所自我評鑑
96/12/16 博士班梁世佑（指導老師夏堪臺）參加臺灣微生物學會第四十週年會員大會暨學術研討會，海報論文展示經評定為臨床微生物學組第二名，並獲頒獎狀乙紙
